RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-215	ENST00000563295	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		12.84	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	SLX4	Q8IY92	1834 aa		12.83	□□□□□ -0.35
KIFC3-215	ENST00000563295	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	PRELP	P51888	382 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC93	Q567U6	631 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	WDR63	Q8IWG1	891 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	SBF1	O95248	1867 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	KIF3C	O14782	793 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	GOLGA2	Q08379	1002 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TSPYL6	Q8N831	410 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	CEP350	Q5VT06	3117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	GLTPD2	A6NH11	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.8	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TOMM70	O94826	608 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	OLFM4	Q6UX06	510 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	SYNE4	Q8N205	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM89A	Q96GI7	184 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	RRAGC	Q9HB90	399 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KIFC3-215	ENST00000563295	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	BBOX1	O75936	387 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF428	Q96B54	188 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	PSMD1	Q99460	953 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	KSR2	Q6VAB6	950 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	MYD88	Q99836	296 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12.76	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ABCC4	O15439	1325 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	VAMP4	O75379	141 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	GRAP	Q13588	217 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	TMC4	Q7Z404	712 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	SP8	Q8IXZ3	490 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	JDP2	Q8WYK2	163 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		12.74	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	HSPA6	P17066	643 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	G2E3	Q7L622	706 aa		12.73	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF521	Q96K83	1311 aa		12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
KIFC3-215	ENST00000563295	FSTL1	Q12841	308 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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