RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-204ENST00000561518 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 GCKRQ14397 625 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 MMP10P09238 476 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 CRBNQ96SW2 442 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-204ENST00000561518 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 PARP10Q53GL7 1025 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 SYNE4Q8N205 404 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 MEIS3Q99687 375 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 NTSR2O95665 410 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 SERPINB2P05120 415 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 MTFR1LQ9H019 292 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 USP44Q9H0E7 712 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 GRM8O00222 908 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 FAM89AQ96GI7 184 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 H7C1W4 665 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 CASP7P55210 303 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 ERFEQ4G0M1 354 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-204ENST00000561518 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 NYXQ9GZU5 481 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 UTYO14607 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 TPTE2Q6XPS3 522 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 CNBD1Q8NA66 436 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC12Q96J65 1359 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 NPHP1O15259 732 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 SUCLG2Q96I99 432 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 GNAI3P08754 354 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 POLD1P28340 1107 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 PTGER2P43116 358 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 KAZALD1Q96I82 304 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-204ENST00000561518 NEFLP07196 543 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 ST5P78524 1137 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 GNAI2P04899 355 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 SPON1Q9HCB6 807 aa21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 FOXO4P98177 505 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 PDE8AO60658 829 aa21.92■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.92■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.91■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 LAMB2P55268 1798 aa21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 CTSWP56202 376 aa21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.89■■□□□ 1.1
RNPS1-204ENST00000561518 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 NLRP3Q96P20 1036 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 KLHL34Q8N239 644 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 CSF1RP07333 972 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 FAM161AQ3B820 660 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 CEP85Q6P2H3 762 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-204ENST00000561518 GREM2Q9H772 168 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms