RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 USP3Q9Y6I4 520 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 REREQ9P2R6 1566 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 FGFR3P22607 806 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 EPHA4P54764 986 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 CTBSQ01459 385 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 FAM182BQ5T319 152 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 POM121Q96HA1 1249 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 KDM5CP41229 1560 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ARAFP10398 606 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 EML3Q32P44 896 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PODNQ7Z5L7 613 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PROCP04070 461 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 BMP4P12644 408 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SKIP12755 728 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 TNP2Q05952 138 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 NCOA4Q13772 614 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ZIC5Q96T25 663 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ZNF358Q9NW07 568 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 NOD1Q9Y239 953 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PRXQ9BXM0 1461 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 A0A1W2PNR3 127 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 FAM157BP0CG42 384 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 EPXP11678 715 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 RXRBP28702 533 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 GTF2IP78347 998 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 GGA1Q9UJY5 639 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 MED14O60244 1454 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC1-211ENST00000560983 USP17L5A8MUK1 530 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 BACH1O14867 736 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 EFSO43281 561 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 FLIIQ13045 1269 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 TEAD4Q15561 434 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 UCN2Q96RP3 112 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 KLF15Q9UIH9 416 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 POM121CA8CG34 1229 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 EML1O00423 815 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 COL8A1P27658 744 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 GGT6Q6P531 493 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 MDFIQ99750 246 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 ABCA6Q8N139 1617 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 KRBA1A5PL33 1030 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 MSTNO14793 375 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 TXLNAP40222 546 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 DGKGP49619 791 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 LAMC2Q13753 1193 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 WWC1Q8IX03 1113 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 BTBD6Q96KE9 485 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC1-211ENST00000560983 DKK1O94907 266 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms