RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 H0YIN7 160 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRNA5P30532 468 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR162Q16538 588 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 ERFEQ4G0M1 354 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 MYD88Q99836 296 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 SLX4Q8IY92 1834 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNA3P22001 575 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 PIM2Q9P1W9 311 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPRCP08575 1304 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 SRGNP10124 158 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 BCS1LQ9Y276 419 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF1P21675 1872 aa24.03■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 GRIN3BO60391 1043 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 CRY2Q49AN0 593 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 STYK1Q6J9G0 422 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 MASTLQ96GX5 879 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-208ENST00000558954 SBF1O95248 1867 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 F6X3S4 739 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 IGKV5-2P06315 115 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 NPR1P16066 1061 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL6Q8N841 843 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 LINS1Q8NG48 757 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM89AQ96GI7 184 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 RARSP54136 660 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 CNKSR1Q969H4 720 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP3Q96P20 1036 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF16BQ96L93 1317 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 SPEF2Q9C093 1822 aa23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 SYNE4Q8N205 404 aa23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 GCKRQ14397 625 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-208ENST00000558954 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH1B1P30837 517 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 BEND3Q5T5X7 828 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 UTRNP46939 3433 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH1L1O75891 902 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE8AO60658 829 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 H7C1W4 665 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 SOGA3Q5TF21 947 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCC4O15439 1325 aa23.89■■□□□ 1.42
RABGGTA-208ENST00000558954 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 BCAR3O75815 825 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 GRM8O00222 908 aa23.88■■□□□ 1.41
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