RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 STK32BQ9NY57 414 aa29.89■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
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MEIS3-204ENST00000558555 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.88■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 CEP85Q6P2H3 762 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 NLRP10Q86W26 655 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 AKT1S1Q96B36 256 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 CASZ1Q86V15 1759 aa29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF827Q17R98 1081 aa29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 PARP10Q53GL7 1025 aa29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 H7C1W4 665 aa29.84■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 IGHDP01880 384 aa29.84■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 HMMRO75330 724 aa29.83■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
MEIS3-204ENST00000558555 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 SUCLG2Q96I99 432 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 ATP8B2P98198 1209 aa29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 CASP7P55210 303 aa29.79■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.79■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB7AO95365 584 aa29.78■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.76■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 FAM89AQ96GI7 184 aa29.76■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 SETDB2Q96T68 719 aa29.76■■■□□ 2.36
MEIS3-204ENST00000558555 SUSD4Q5VX71 490 aa29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 SPON1Q9HCB6 807 aa29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 MSH5O43196 834 aa29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 KAZALD1Q96I82 304 aa29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 FAM177BA6PVY3 158 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 MTX1Q13505 466 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 SRGAP3O43295 1099 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 GCC1Q96CN9 775 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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MEIS3-204ENST00000558555 SSH3Q8TE77 659 aa29.72■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.72■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 NYXQ9GZU5 481 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 NTSR2O95665 410 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 SMC5Q8IY18 1101 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-204ENST00000558555 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 DCTPP1Q9H773 170 aa29.7■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 FOXO4P98177 505 aa29.69■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 POLA2Q14181 598 aa29.69■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 MYH3P11055 1940 aa29.69■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.68■■■□□ 2.34
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MEIS3-204ENST00000558555 NFIXQ14938 502 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 SYNE4Q8N205 404 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 PDE8AO60658 829 aa29.66■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 LAMB2P55268 1798 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 PTGER2P43116 358 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 MTFR1LQ9H019 292 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 NPHP1O15259 732 aa29.64■■■□□ 2.34
MEIS3-204ENST00000558555 CTSWP56202 376 aa29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 TM4SF1P30408 202 aa29.62■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 ERFEQ4G0M1 354 aa29.62■■■□□ 2.33
MEIS3-204ENST00000558555 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.62■■■□□ 2.33
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