RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557594.5

NRXN3-215, Transcript of neurexin 3, human

TSL 2 BASIC

Gene NRXN3, Length 3,381 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN3-215	ENST00000557594	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	TOM1	O60784	492 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF165	P49910	485 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	PSME1	Q06323	249 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CAVIN2	O95810	425 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	SIRT1	Q96EB6	747 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ACE	P12821	1306 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	PSMA5	P28066	241 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	KCNB2	Q92953	911 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	NEMF	O60524	1076 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CDC25B	P30305	580 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	KDR	P35968	1356 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	SLIT1	O75093	1534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	FLT4	P35916	1363 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NRXN3-215	ENST00000557594	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	AMPH	P49418	695 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	EYA1	Q99502	592 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	NR1I2	O75469	434 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	HIP1	O00291	1037 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	USP6	P35125	1406 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	TERF2	Q15554	542 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SKIL	P12757	684 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	ORAI2	Q96SN7	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	TECPR2	O15040	1411 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	SLC27A2	O14975	620 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NRXN3-215	ENST00000557594	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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