RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SETDB2Q96T68 719 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-210ENST00000551525 CRBNQ96SW2 442 aa7.34□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 B4DLN1 442 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 ZFYVE9O95405 1425 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 SH3GL3Q99963 347 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 DCAF5Q96JK2 942 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRB-210ENST00000551525 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PLIN1O60240 522 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PSMA5P28066 241 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NUCB2P80303 420 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP3Q96P20 1036 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SUFUQ9UMX1 484 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NECTIN2Q92692 538 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IFT57Q9NWB7 429 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM94Q12767 1356 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TRAK2O60296 914 aa7.3□□□□□ -1.24
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