RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 LGR6Q9HBX8 967 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 HRO43593 1189 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 GLTPD2A6NH11 291 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 FOXN1O15353 648 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 DDR1Q08345 913 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 NBR1Q14596 966 aa12.8□□□□□ -0.36
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CS-217ENST00000550044 MFRPQ9BY79 579 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.8□□□□□ -0.36
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CS-217ENST00000550044 FAM161AQ3B820 660 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
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CS-217ENST00000550044 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 PSEN2P49810 448 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 DLEC1Q9Y238 1755 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 IL17REQ8NFR9 667 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 NEFMP07197 916 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 AIDAQ96BJ3 306 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 CNTNAP1P78357 1384 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 POTECB2RU33 542 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 SLC39A6Q13433 755 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 TJP1Q07157 1748 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 STK25O00506 426 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 ANP32CO43423 234 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-217ENST00000550044 DCTN1Q14203 1278 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 CCDC184Q52MB2 194 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-217ENST00000550044 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-217ENST00000550044 PTPN5P54829 565 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 TEFQ10587 303 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 ABHD8Q96I13 439 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 RGL2O15211 777 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-217ENST00000550044 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.71□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 TM4SF1P30408 202 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 TTLL6Q8N841 843 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 ZPR1O75312 459 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 VEGFBP49765 207 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 NEUROD2Q15784 382 aa12.69□□□□□ -0.38
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CS-217ENST00000550044 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 BTBD11A6QL63 1104 aa12.68□□□□□ -0.38
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CS-217ENST00000550044 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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CS-217ENST00000550044 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 NFIXQ14938 502 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-217ENST00000550044 ZNF790Q6PG37 636 aa12.67□□□□□ -0.38
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