RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528118.5

TMPRSS4-217, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 3,838 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-217ENST00000528118 TEFQ10587 303 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TMPRSS4-217ENST00000528118 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 A0A087WWV3 80 aa9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.9□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CPLX1O14810 134 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 SLFN14P0C7P3 912 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PTH1RQ03431 593 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 USP27XA6NNY8 438 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 RAPGEF3O95398 923 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 EVI5LQ96CN4 794 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TMEM51Q9NW97 253 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 IFNKQ9P0W0 207 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.89□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TPM1P09493 284 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CERS3Q8IU89 383 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 SHPRHQ149N8 1683 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ANXA1P04083 346 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 OLFM4Q6UX06 510 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 STAP2Q9UGK3 403 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ABCC1P33527 1531 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ATP10DQ9P241 1426 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 KRT32Q14532 448 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 IL25Q9H293 177 aa9.88□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 REREQ9P2R6 1566 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 JAK2O60674 1132 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 GNG11P61952 73 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ATP7AQ04656 1500 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CASQ1P31415 396 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CCDC102AQ96A19 550 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CARD6Q9BX69 1037 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 KIF1BO60333 1816 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZSCAN12O43309 604 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 FAM227BQ96M60 508 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 AOX1Q06278 1338 aa9.87□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 EVCP57679 992 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 MCM6Q14566 821 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 NEK1Q96PY6 1258 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CBFA2T2O43439 604 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 TTC14Q96N46 770 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 USP44Q9H0E7 712 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.86□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 CLCN6P51797 869 aa9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 SHROOM2Q13796 1616 aa9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 KIAA0232Q92628 1395 aa9.85□□□□□ -0.83
TMPRSS4-217ENST00000528118 SLC27A2O14975 620 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms