RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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ACER3-204ENST00000525861 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.5■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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ACER3-204ENST00000525861 NLRP10Q86W26 655 aa28.49■■■□□ 2.15
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ACER3-204ENST00000525861 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.48■■■□□ 2.15
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ACER3-204ENST00000525861 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.47■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.47■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 FAM182BQ5T319 152 aa28.46■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 AACSQ86V21 672 aa28.46■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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ACER3-204ENST00000525861 FAM89AQ96GI7 184 aa28.46■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ACER3-204ENST00000525861 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.45■■■□□ 2.14
ACER3-204ENST00000525861 GPATCH3Q96I76 525 aa28.45■■■□□ 2.14
ACER3-204ENST00000525861 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.44■■■□□ 2.14
ACER3-204ENST00000525861 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ACER3-204ENST00000525861 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.44■■■□□ 2.14
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ACER3-204ENST00000525861 SBF2Q86WG5 1849 aa28.44■■■□□ 2.14
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ACER3-204ENST00000525861 CAMTA2O94983 1202 aa28.42■■■□□ 2.14
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ACER3-204ENST00000525861 CNTROBQ8N137 903 aa28.38■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 REC8O95072 547 aa28.37■■■□□ 2.13
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ACER3-204ENST00000525861 TNNI3KQ59H18 835 aa28.37■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.37■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 SYNE4Q8N205 404 aa28.37■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.37■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 LY75O60449 1722 aa28.37■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 BCORQ6W2J9 1755 aa28.37■■■□□ 2.13
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ACER3-204ENST00000525861 CTSWP56202 376 aa28.33■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.33■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 GPR108Q9NPR9 543 aa28.33■■■□□ 2.13
ACER3-204ENST00000525861 PDE8AO60658 829 aa28.32■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 SUSD4Q5VX71 490 aa28.32■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.32■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ACER3-204ENST00000525861 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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