RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 CAMTA2O94983 1202 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 RPS6KA4O75676 772 aa25.93■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 NLRP10Q86W26 655 aa25.93■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 NBR1Q14596 966 aa25.92■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 FAM89AQ96GI7 184 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 APBA3O96018 575 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 C4BP0C0L5 1744 aa25.89■■□□□ 1.74
CLDN23-201ENST00000519106 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 AK7Q96M32 723 aa25.89■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.89■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 PROM2Q8N271 834 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 TXNRD1Q16881 649 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 FOXO4P98177 505 aa25.87■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 SYNE4Q8N205 404 aa25.87■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 PHF14O94880 888 aa25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 FAM177BA6PVY3 158 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 PLSCR1O15162 318 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 NARFQ9UHQ1 456 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 ZPR1O75312 459 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 SUSD4Q5VX71 490 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 RAB11FIP3O75154 756 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN23-201ENST00000519106 BCORQ6W2J9 1755 aa25.82■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.82■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 PARP10Q53GL7 1025 aa25.81■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 SIL1Q9H173 461 aa25.81■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.81■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 RFC4P35249 363 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.79■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.79■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.78■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.78■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 SCN7AQ01118 1682 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 COPRSQ9NQ92 184 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN23-201ENST00000519106 FAM161AQ3B820 660 aa25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 RGL2O15211 777 aa25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 ADRA2BP18089 450 aa25.76■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 NTSR2O95665 410 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 BACH2Q9BYV9 841 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 C4AP0C0L4 1744 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 PDE8AO60658 829 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 CSF1RP07333 972 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 C8orf34Q49A92 452 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 CTSWP56202 376 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 SETDB2Q96T68 719 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 SASH1O94885 1247 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 SSFA2P28290 1259 aa25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CLDN23-201ENST00000519106 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms