RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 CPDO75976 1380 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 FOXO3O43524 673 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 NBPF14Q5TI25 921 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 SPRYD7Q5W111 196 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 NCAPD2Q15021 1401 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 SLIT2O94813 1529 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 ABL2P42684 1182 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 AGERQ15109 404 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF511Q8NB15 262 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 TMC1Q8TDI8 760 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 AFF2P51816 1311 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 RAD21O60216 631 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 SH3BP2P78314 561 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 SKOR1P84550 965 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 FOXC1Q12948 553 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 NME9Q86XW9 330 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 FOXJ1Q92949 421 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 PANK3Q9H999 370 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-212ENST00000498694 RGPD5Q99666 1765 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 LRRC37A3O60309 1634 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 FYB1O15117 783 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 WNT7BP56706 349 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 POM121Q96HA1 1249 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 COG6Q9Y2V7 657 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 FLT4P35916 1363 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 GLI3P10071 1580 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PSME1Q06323 249 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 INSRP06213 1382 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 KIAA0232Q92628 1395 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 TNFRSF10AO00220 468 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PTK2Q05397 1052 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ZBTB33Q86T24 672 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC125Q86Z20 511 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 NGLY1Q96IV0 654 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 KNSTRNQ9Y448 316 aa5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 DISP2A7MBM2 1401 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 NLRP13Q86W25 1043 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 WWC1Q8IX03 1113 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ABTB2Q8N961 1025 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 COG3Q96JB2 828 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 C8orf37Q96NL8 207 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ATRNO75882 1429 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 KDRP35968 1356 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ZBBXA8MT70 800 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 WNT7AO00755 349 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 GPR37L1O60883 481 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 ADAMTS2O95450 1211 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-212ENST00000498694 GCP02774 474 aa5.48□□□□□ -1.53
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