RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 ALDH1L1O75891 902 aa28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 GCKRQ14397 625 aa28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 SYNE4Q8N205 404 aa28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 NTSR2O95665 410 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 MS4A1P11836 297 aa28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 PTGER2P43116 358 aa28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 PDE3AQ14432 1141 aa28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 FAM89AQ96GI7 184 aa28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 COG6Q9Y2V7 657 aa28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 POLD1P28340 1107 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 ERFEQ4G0M1 354 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 SPON1Q9HCB6 807 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1C-215ENST00000498183 H7C1W4 665 aa28.01■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 TPTE2Q6XPS3 522 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 CNBD1Q8NA66 436 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 NYXQ9GZU5 481 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 USP44Q9H0E7 712 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 NPHP1O15259 732 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCC12Q96J65 1359 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 GRM8O00222 908 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 CASP7P55210 303 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 MEIS3Q99687 375 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 CRBNQ96SW2 442 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1C-215ENST00000498183 UTYO14607 1347 aa27.94■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 ST5P78524 1137 aa27.94■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 SUCLG2Q96I99 432 aa27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 KAZALD1Q96I82 304 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 KLHL34Q8N239 644 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 GNAI3P08754 354 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 PDE8AO60658 829 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 FOXO4P98177 505 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 LAMB2P55268 1798 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 NLRP3Q96P20 1036 aa27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 GNAI2P04899 355 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHRNA5P30532 468 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 CTSWP56202 376 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1C-215ENST00000498183 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 PDE6BP35913 854 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 CSF1RP07333 972 aa27.8■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms