RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.52■■□□□ 1.36
PKN3-202ENST00000483521 NPR1P16066 1061 aa23.52■■□□□ 1.36
PKN3-202ENST00000483521 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.52■■□□□ 1.36
PKN3-202ENST00000483521 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.52■■□□□ 1.36
PKN3-202ENST00000483521 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.51■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 NTSR2O95665 410 aa23.5■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 SUSD4Q5VX71 490 aa23.5■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.5■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.5■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 TCIRG1Q13488 830 aa23.49■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ERFEQ4G0M1 354 aa23.49■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 SOGA3Q5TF21 947 aa23.49■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ABCC12Q96J65 1359 aa23.49■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.48■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ALDH1B1P30837 517 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 NLRP10Q86W26 655 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 TSPYL6Q8N831 410 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 STK31Q9BXU1 1019 aa23.47■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 CRY2Q49AN0 593 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.46■■□□□ 1.35
PKN3-202ENST00000483521 C21orf2O43822 256 aa23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 MS4A1P11836 297 aa23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 RNF181Q9P0P0 153 aa23.45■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 LMNB1P20700 586 aa23.44■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 NLRP3Q96P20 1036 aa23.43■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 RASSF7Q02833 373 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 SLX4Q8IY92 1834 aa23.42■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 KIF16BQ96L93 1317 aa23.41■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 NFKBIEO00221 500 aa23.41■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 CACNA1SQ13698 1873 aa23.41■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 PDE3AQ14432 1141 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 CCDC93Q567U6 631 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.4■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 SBF1O95248 1867 aa23.39■■□□□ 1.34
PKN3-202ENST00000483521 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.39■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 VAMP4O75379 141 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.38■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.37■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.37■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 SLC4A2P04920 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.36■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 BCAR3O75815 825 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 AAMPQ13685 434 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 KSR2Q6VAB6 950 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 MYD88Q99836 296 aa23.35■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 CACNA1FO60840 1977 aa23.34■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.33■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.33■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.33■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.33■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 FAM89AQ96GI7 184 aa23.33■■□□□ 1.33
PKN3-202ENST00000483521 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 PRELPP51888 382 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 FLIIQ13045 1269 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 SYNE4Q8N205 404 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PKN3-202ENST00000483521 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.3■■□□□ 1.32
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