RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 GRM8O00222 908 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-208ENST00000481211 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-208ENST00000481211 TM4SF1P30408 202 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-208ENST00000481211 FKBP8Q14318 412 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-208ENST00000481211 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.39■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 CRBNQ96SW2 442 aa16.39■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 UBN2Q6ZU65 1347 aa16.39■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 SOCS7O14512 581 aa16.38■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.38■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.37■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.37■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.35■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-208ENST00000481211 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.33■□□□□ 0.21
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NISCH-208ENST00000481211 ST5P78524 1137 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.33■□□□□ 0.2
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NISCH-208ENST00000481211 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 HMMRO75330 724 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 MSL1Q68DK7 614 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 SUCLG2Q96I99 432 aa16.29■□□□□ 0.2
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NISCH-208ENST00000481211 RTL9Q8NET4 1388 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 FAM177BA6PVY3 158 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 CTSWP56202 376 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 ERFEQ4G0M1 354 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 NLRP3Q96P20 1036 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 MYH3P11055 1940 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 CSF1RP07333 972 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 FOXO4P98177 505 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 ATP8B2P98198 1209 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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NISCH-208ENST00000481211 CEP85Q6P2H3 762 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 KAZALD1Q96I82 304 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-208ENST00000481211 ABCC12Q96J65 1359 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB7AO95365 584 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 PDE6BP35913 854 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 SSH3Q8TE77 659 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 SPON1Q9HCB6 807 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-208ENST00000481211 SRGAP3O43295 1099 aa16.24■□□□□ 0.19
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