RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		12.15	□□□□□ -0.46
QARS-215	ENST00000479495	COL4A5	P29400	1685 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	SOX10	P56693	466 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	USP16	Q9Y5T5	823 aa		12.14	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		12.13	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.13	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	BTBD11	A6QL63	1104 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	NOG	Q13253	232 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	NIM1K	Q8IY84	436 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		12.12	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	NUP98	P52948	1817 aa		12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	RGL2	O15211	777 aa		12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	PPIP5K2	O43314	1243 aa		12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	KCNQ3	O43525	872 aa		12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	NYX	Q9GZU5	481 aa		12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	HUNK	P57058	714 aa		12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	CRY2	Q49AN0	593 aa		12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	ZIC5	Q96T25	663 aa		12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
QARS-215	ENST00000479495	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	HLF	Q16534	295 aa		12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	AOC3	Q16853	763 aa		12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		12.08	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CXCL9	Q07325	125 aa		12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		12.07	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	ABCC12	Q96J65	1359 aa		12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	TRPA1	O75762	1119 aa		12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		12.06	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NBPF26	B4DH59	902 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RGMB	Q6NW40	437 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	USP48	Q86UV5	1035 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NBPF15	Q8N660	670 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	GCC1	Q96CN9	775 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495		H7C1D1	291 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	TNIP1	Q15025	636 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	SLC51A	Q86UW1	340 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	NGEF	Q8N5V2	710 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RNF186	Q9NXI6	227 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RAD17	O75943	681 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-215	ENST00000479495	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	GPT	P24298	496 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	DLK2	Q6UY11	383 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-215	ENST00000479495	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		12	□□□□□ -0.49

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