RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 NEURL1BA8MQ27 555 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRD-209ENST00000477552 SLC27A2O14975 620 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC192P0DO97 292 aa9.94□□□□□ -0.82
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