RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475170.5

ITGB2-209, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB2, Length 2,125 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-209ENST00000475170 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.66■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 SEC24BO95487 1268 aa20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 GPTP24298 496 aa20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 NLRP10Q86W26 655 aa20.65■□□□□ 0.9
ITGB2-209ENST00000475170 CAMTA2O94983 1202 aa20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 LY75O60449 1722 aa20.64■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 SMIM5Q71RC9 77 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 SYNE4Q8N205 404 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 FAM89AQ96GI7 184 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 PDE1AP54750 535 aa20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.61■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 TTC22Q5TAA0 569 aa20.61■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 SASH1O94885 1247 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 FBXO41Q8TF61 875 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 COPRSQ9NQ92 184 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 TRIM37O94972 964 aa20.59■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 SIL1Q9H173 461 aa20.59■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.59■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.58■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 STAP2Q9UGK3 403 aa20.58■□□□□ 0.89
ITGB2-209ENST00000475170 RPS6KA4O75676 772 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 MX1P20591 662 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 RXRBP28702 533 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 SUSD4Q5VX71 490 aa20.56■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.56■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 GNPATO15228 680 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 CSF1RP07333 972 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 POTEAQ6S8J7 498 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 BCORQ6W2J9 1755 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 SDSP20132 328 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 C4BP0C0L5 1744 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 PROM2Q8N271 834 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ITGB2-209ENST00000475170 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 NARFQ9UHQ1 456 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 PARP10Q53GL7 1025 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 FAM177BA6PVY3 158 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 NTSR2O95665 410 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 AOX1Q06278 1338 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 TFCP2Q12800 502 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 RGL2O15211 777 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 CTSWP56202 376 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 LRRC24Q50LG9 513 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 AACSQ86V21 672 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 PDE8AO60658 829 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ITGB2-209ENST00000475170 GREM2Q9H772 168 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms