RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 FZD9O00144 591 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 FOXN1O15353 648 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 ALDH1B1P30837 517 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 VEGFBP49765 207 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 SCN4AP35499 1836 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 NTSR2O95665 410 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 NEFMP07197 916 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 NYXQ9GZU5 481 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 CNTNAP1P78357 1384 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 LTBP1Q14766 1721 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 RGL2O15211 777 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 PDIA6Q15084 440 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 KRT24Q2M2I5 525 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 EPS15P42566 896 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 CNTROBQ8N137 903 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 PSMD1Q99460 953 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 RIPK4P57078 832 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-209ENST00000473257 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 JDP2Q8WYK2 163 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 TRAF5O00463 557 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 SCNN1DP51172 638 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 NEUROD2Q15784 382 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 AOC3Q16853 763 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 ABCC4O15439 1325 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 PPIP5K2O43314 1243 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 GRM1Q13255 1194 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 COPS6Q7L5N1 327 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 NIM1KQ8IY84 436 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 TAF1P21675 1872 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-209ENST00000473257 NLRP10Q86W26 655 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 NLRP3Q96P20 1036 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 ERBB4Q15303 1308 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 SHTN1A0MZ66 631 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 PARP10Q53GL7 1025 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 AIDAQ96BJ3 306 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 WBP1LQ9NX94 342 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 LAMB2P55268 1798 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 RASSF10A6NK89 507 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 RAD17O75943 681 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 CXCL9Q07325 125 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 CST9Q5W186 159 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-209ENST00000473257 COL4A1P02462 1669 aa14.71□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 DLK2Q6UY11 383 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 TCIRG1Q13488 830 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 TSKSQ9UJT2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 AOC2O75106 756 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 MPNDQ8N594 471 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.68□□□□□ -0.06
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