RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 NBPF26B4DH59 902 aa16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 A1BGP04217 495 aa16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 PDE1AP54750 535 aa16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 NBPF14Q5TI25 921 aa16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 NBPF15Q8N660 670 aa16.72■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 MBD3O95983 291 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 ATP2B3Q16720 1220 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 LINS1Q8NG48 757 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
GPC1-208ENST00000469694 KAZALD1Q96I82 304 aa16.71■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SUCLG2Q96I99 432 aa16.71■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.71■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.71■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 GRM8O00222 908 aa16.7■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 POLA2Q14181 598 aa16.7■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ALDH1L1O75891 902 aa16.7■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 TSPY26PQ9H489 355 aa16.7■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 PIGBQ92521 554 aa16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 KIF3AQ9Y496 699 aa16.69■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ST18O60284 1047 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 MX1P20591 662 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.68■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 GLI3P10071 1580 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 A0A0G2JS52 829 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 GCKRQ14397 625 aa16.67■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SIL1Q9H173 461 aa16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.65■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.64■□□□□ 0.26
GPC1-208ENST00000469694 RILPL2Q969X0 211 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 FAM177BA6PVY3 158 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 UVSSAQ2YD98 709 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.64■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 EXOC5O00471 708 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 ATG3Q9NT62 314 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 MPNDQ8N594 471 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 MTX1Q13505 466 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.63■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 DISP2A7MBM2 1401 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 UTYO14607 1347 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 A0A087WZG4 1122 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TOM1O60784 492 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 RAB11FIP3O75154 756 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 BRD1O95696 1058 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 PHF14O94880 888 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 PHLPP1O60346 1717 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-208ENST00000469694 TNS2Q63HR2 1409 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms