RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ARAFP10398 606 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SCNN1AP37088 669 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMC2Q13753 1193 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 COX20Q5RI15 118 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 ITGB2P05107 769 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 EPXP11678 715 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SPEM2Q0P670 501 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT9Q86SS6 491 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 MYO19Q96H55 970 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 USP20Q9Y2K6 914 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 PROCP04070 461 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 ADH6P28332 368 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 IDH3AP50213 366 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNQ4P56696 695 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM26DQ5JW98 314 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 DCAF5Q96JK2 942 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP2B4P23634 1241 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 IER5Q5VY09 327 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 IFT43Q96FT9 208 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 BTBD6Q96KE9 485 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 MICAL2O94851 1124 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 AMPD1P23109 780 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 INPP5BP32019 993 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 HIF1AQ16665 826 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 BHMTQ93088 406 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 RRAGCQ9HB90 399 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 SEPT3Q9UH03 358 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-206ENST00000467748 C16orf46Q6P387 395 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF10BO14763 440 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 TREML1Q86YW5 311 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 GSX2Q9BZM3 304 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 OPLAHO14841 1288 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 CHSY3Q70JA7 882 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 MDFIQ99750 246 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 SIN3BO75182 1162 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ARSDP51689 593 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 COL26A1Q96A83 441 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 IGFLR1Q9H665 355 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 NFKB1P19838 968 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 LCE3BQ5TA77 95 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ELOA3Q8NG57 546 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB39O15060 712 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 SSFA2P28290 1259 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 DGKGP49619 791 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 CCINQ13939 588 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 PODNQ7Z5L7 613 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF25Q93038 417 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ZFATQ9P243 1243 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 SASH3O75995 380 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 ADH7P40394 386 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-206ENST00000467748 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms