RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ST5	P78524	1137 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SBF1	O95248	1867 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MRC1	P22897	1456 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RASSF7	Q02833	373 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TJP1	Q07157	1748 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NFKBIE	O00221	500 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C21orf2	O43822	256 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HMOX1	P09601	288 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLCN1	P35523	988 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HTRA3	P83110	453 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POTEM	A6NI47	508 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TPM2	P07951	284 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPR1	P16066	1061 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MRE11	P49959	708 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SRGN	P10124	158 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TIE1	P35590	1138 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676		E9PSI1	815 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61

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