RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	G2E3	Q7L622	706 aa		22.74	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	NLRP10	Q86W26	655 aa		22.74	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	22.74	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		22.73	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	NTSR2	O95665	410 aa		22.72	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	TTLL6	Q8N841	843 aa		22.72	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	MYD88	Q99836	296 aa		22.72	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		22.72	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	22.72	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF8	P60827	252 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	KSR2	Q6VAB6	950 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	ABCC12	Q96J65	1359 aa		22.71	■■□□□ 1.23
USP19-210	ENST00000465902	SRGN	P10124	158 aa		22.7	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	FLII	Q13045	1269 aa		22.7	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	22.7	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	MASTL	Q96GX5	879 aa		22.7	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		22.7	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	22.69	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	NPR1	P16066	1061 aa		22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	STYK1	Q6J9G0	422 aa		22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	CNKSR1	Q969H4	720 aa		22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	SYNE4	Q8N205	404 aa		22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	NLRP3	Q96P20	1036 aa		22.67	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	22.66	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	FAM89A	Q96GI7	184 aa		22.66	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	SLX4	Q8IY92	1834 aa		22.66	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	22.65	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
USP19-210	ENST00000465902	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	22.64	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		22.64	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	22.64	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	C21orf2	O43822	256 aa		22.63	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		22.63	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		22.63	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	LAMB2	P55268	1798 aa		22.63	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	ALDH1B1	P30837	517 aa		22.62	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		22.62	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	22.62	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		22.62	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		22.62	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CRY2	Q49AN0	593 aa		22.61	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	22.61	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	22.61	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902		F6X3S4	739 aa		22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		22.6	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	IGKV5-2	P06315	115 aa		22.59	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		22.59	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		22.59	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		22.58	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		22.58	■■□□□ 1.21
USP19-210	ENST00000465902	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	SBF1	O95248	1867 aa		22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	TAF1	P21675	1872 aa		22.57	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	22.56	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	RASSF7	Q02833	373 aa		22.56	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	22.56	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	LINS1	Q8NG48	757 aa		22.56	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		22.56	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	KIF3C	O14782	793 aa		22.55	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	SOGA3	Q5TF21	947 aa		22.55	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		22.54	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	GCKR	Q14397	625 aa		22.54	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	CCDC93	Q567U6	631 aa		22.54	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	22.54	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	MYH3	P11055	1940 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	OLFM4	Q6UX06	510 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	RNF181	Q9P0P0	153 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	ABCC4	O15439	1325 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	PTPRC	P08575	1304 aa		22.53	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	PDE8A	O60658	829 aa		22.52	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	BEND3	Q5T5X7	828 aa		22.52	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		22.52	■■□□□ 1.2
USP19-210	ENST00000465902	NFKBIE	O00221	500 aa		22.51	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	22.51	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	22.51	■■□□□ 1.19

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