RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-206ENST00000465525 FAM177BA6PVY3 158 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 GRM8O00222 908 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 NLRP10Q86W26 655 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 GNAI3P08754 354 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 GNAI2P04899 355 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 SUSD4Q5VX71 490 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 SYNE4Q8N205 404 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 FAM89AQ96GI7 184 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 SUCLG2Q96I99 432 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 UTYO14607 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 H7C1W4 665 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 SETDB2Q96T68 719 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 CASP7P55210 303 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 AAMPQ13685 434 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-206ENST00000465525 TM4SF1P30408 202 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 PARP10Q53GL7 1025 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 NFIXQ14938 502 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 MSL1Q68DK7 614 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 KAZALD1Q96I82 304 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 CEP85Q6P2H3 762 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 IGHDP01880 384 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 MTFR1LQ9H019 292 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 NTSR2O95665 410 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 CASZ1Q86V15 1759 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 ZBTB7AO95365 584 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 MYH3P11055 1940 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 MMP10P09238 476 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-206ENST00000465525 LAMB2P55268 1798 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 ERFEQ4G0M1 354 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 NYXQ9GZU5 481 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 SERPINB2P05120 415 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 FOXO4P98177 505 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 DDR1Q08345 913 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 ATP8B2P98198 1209 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC12Q96J65 1359 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 NPHP1O15259 732 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 SRGAP3O43295 1099 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 POLD1P28340 1107 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 CNBD1Q8NA66 436 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-206ENST00000465525 PDE8AO60658 829 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 SPON1Q9HCB6 807 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 CTSWP56202 376 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 MTX1Q13505 466 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-206ENST00000465525 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.44■■□□□ 1.02
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