RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 FAM227BQ96M60 508 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 MYD88Q99836 296 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 FSD1Q9BTV5 496 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 KCNB2Q92953 911 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 RGPD5Q99666 1765 aa21.96■■□□□ 1.11
SYNE4-204ENST00000465425 LARGE1O95461 756 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 F13A1P00488 732 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 GJB2P29033 226 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.95■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 MAP4K1Q92918 833 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 MST1RQ04912 1400 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 PSMA5P28066 241 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ATF3P18847 181 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 RNF20Q5VTR2 975 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2HP62256 183 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0D9SFI3 127 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 FIBPO43427 364 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF5Q96JK2 942 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 C5P01031 1676 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.91■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 SLC27A2O14975 620 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 USP16Q9Y5T5 823 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 MEGF6O75095 1541 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ME3Q16798 604 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 SNRKQ9NRH2 765 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 ALS2Q96Q42 1657 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.89■■□□□ 1.1
SYNE4-204ENST00000465425 TCHHQ07283 1943 aa21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 COPRSQ9NQ92 184 aa21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD1Q15327 319 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 MTMR6Q9Y217 621 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 NECAB1Q8N987 351 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 MRC1P22897 1456 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 MED23Q9ULK4 1368 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 CYP27B1O15528 508 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 CHRNA2Q15822 529 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 CABP4P57796 275 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 TNNI3KQ59H18 835 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 DTNBO60941 627 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 OFD1O75665 1012 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SYNE4-204ENST00000465425 ST3GAL1Q11201 340 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 A0A087WZG4 1122 aa21.84■■□□□ 1.09
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SYNE4-204ENST00000465425 MCM5P33992 734 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 TFCP2Q12800 502 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PDCP20941 246 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 RPS6KB1P23443 525 aa21.84■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 UVSSAQ2YD98 709 aa21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.83■■□□□ 1.09
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