RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462993.1

SNX10-208, Transcript of sorting nexin 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNX10, Length 806 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10-208ENST00000462993 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 ZIC5Q96T25 663 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 SLAIN2Q9P270 581 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.28□□□□□ -1.24
SNX10-208ENST00000462993 SFI1A8K8P3 1242 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 FAM229AH3BQW9 127 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 M0R2N6 131 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 APBA3O96018 575 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ALAS2P22557 587 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SSFA2P28290 1259 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 KCNA1Q09470 495 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 CABP1Q9NZU7 370 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 MARK1Q9P0L2 795 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 USP3Q9Y6I4 520 aa7.27□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SMARCA2P51531 1590 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 FAM157BP0CG42 384 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SYT9Q86SS6 491 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ELOA3Q8NG57 546 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 DYRK3O43781 588 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 HINFPQ9BQA5 517 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZNF358Q9NW07 568 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 WIZO95785 1651 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 A6NJY4 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 M0R082 166 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 BACH1O14867 736 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 GRIK4Q16099 956 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ARTNQ5T4W7 220 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 NBPF11Q86T75 865 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 NCAPD3P42695 1498 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 CDK2AP1O14519 115 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 EFSO43281 561 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ATP2B4P23634 1241 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 TXLNAP40222 546 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 OCLNQ16625 522 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 HMGXB3Q12766 1538 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX10-208ENST00000462993 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 WEE1P30291 646 aa7.21□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.21□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.21□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.21□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 ERCC6Q03468 1493 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 PRMT3O60678 531 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 LAMC2Q13753 1193 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 MTFR1Q15390 333 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 TNS4Q8IZW8 715 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 NESP48681 1621 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 LGR5O75473 907 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 ALBP02768 609 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 EPHA4P54764 986 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 LCE3BQ5TA77 95 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 NACC1Q96RE7 527 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 SLC30A3Q99726 388 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 SIN3BO75182 1162 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 MDFIQ99750 246 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 IGFBP4P22692 258 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.17□□□□□ -1.26
SNX10-208ENST00000462993 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms