RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 ZNF853P0CG23 659 aa34.7■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.7■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 GNAI1P63096 354 aa34.69■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 MBIPQ9NS73 344 aa34.69■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.68■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 FSTL1Q12841 308 aa34.67■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.66■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.66■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 WDR90Q96KV7 1748 aa34.66■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 APLP1P51693 650 aa34.64■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 TCIRG1Q13488 830 aa34.64■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.64■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
ODC1-204ENST00000446285 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.63■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 NLRP3Q96P20 1036 aa34.63■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 CRAMP1Q96RY5 1269 aa34.63■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 HYPKQ9NX55 129 aa34.63■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 ANP32CO43423 234 aa34.62■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 NLRP10Q86W26 655 aa34.61■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.61■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.61■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 CCDC184Q52MB2 194 aa34.59■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.59■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 SMC1BQ8NDV3 1235 aa34.59■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 CCDC27Q2M243 656 aa34.58■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 PSMD1Q99460 953 aa34.58■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 SNED1Q8TER0 1413 aa34.57■■■■□ 3.13
ODC1-204ENST00000446285 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 OLFM4Q6UX06 510 aa34.56■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.55■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 MRS2Q9HD23 443 aa34.55■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 SYNE4Q8N205 404 aa34.54■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.53■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 LAMB2P55268 1798 aa34.53■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 POTECB2RU33 542 aa34.52■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.51■■■■□ 3.12
ODC1-204ENST00000446285 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 SCN4AP35499 1836 aa34.5■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 IQCA1LA6NCM1 817 aa34.49■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA2Q08379 1002 aa34.49■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 C8orf58Q8NAV2 365 aa34.48■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 ABCC4O15439 1325 aa34.48■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 WWC1Q8IX03 1113 aa34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 JDP2Q8WYK2 163 aa34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.47■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 BBOX1O75936 387 aa34.46■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 FZD9O00144 591 aa34.45■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.45■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 IL16Q14005 1332 aa34.45■■■■□ 3.11
ODC1-204ENST00000446285 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 VPS33BQ9H267 617 aa34.43■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.42■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.42■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 TMC4Q7Z404 712 aa34.42■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 DDX58O95786 925 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 GRAPQ13588 217 aa34.41■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 SP8Q8IXZ3 490 aa34.4■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 SUPT20HQ8NEM7 779 aa34.4■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 GPC2Q8N158 579 aa34.39■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 LARGE2Q8N3Y3 721 aa34.39■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.39■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ODC1-204ENST00000446285 EIF6P56537 245 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 FAM89AQ96GI7 184 aa34.38■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 CHADLQ6NUI6 762 aa34.37■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 TSPYL6Q8N831 410 aa34.37■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 STK31Q9BXU1 1019 aa34.36■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.35■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 HACL1Q9UJ83 578 aa34.35■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 LDHDQ86WU2 507 aa34.34■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 WDR63Q8IWG1 891 aa34.34■■■■□ 3.09
ODC1-204ENST00000446285 NIM1KQ8IY84 436 aa34.34■■■■□ 3.09
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