RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFKBIEO00221 500 aa20.94■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.94■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL16Q14005 1332 aa20.94■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.94■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NLRP10Q86W26 655 aa20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STK31Q9BXU1 1019 aa20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRY2Q49AN0 593 aa20.92■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLX4Q8IY92 1834 aa20.92■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SBF1O95248 1867 aa20.91■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.91■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.91■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR63Q8IWG1 891 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSPYL6Q8N831 410 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF3CO14782 793 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GLTPD2A6NH11 291 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRELPP51888 382 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF428Q96B54 188 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOMM70O94826 608 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYD88Q99836 296 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RRAGCQ9HB90 399 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OLFM4Q6UX06 510 aa20.83■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.83■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM89AQ96GI7 184 aa20.83■□□□□ 0.93
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.82■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC4A2P04920 1241 aa20.81■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYNE4Q8N205 404 aa20.81■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.81■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCC4O15439 1325 aa20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BBOX1O75936 387 aa20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KSR2Q6VAB6 950 aa20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMD1Q99460 953 aa20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JDP2Q8WYK2 163 aa20.79■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRAPQ13588 217 aa20.78■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.78■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.77■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAMB2P55268 1798 aa20.77■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCER2I3L3R5 266 aa20.76■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FLIIQ13045 1269 aa20.76■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMC4Q7Z404 712 aa20.76■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VAMP4O75379 141 aa20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA6P17066 643 aa20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.75■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SP8Q8IXZ3 490 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms