RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 MST1RQ04912 1400 aa20.1■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 KRT85P78386 507 aa20.09■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 ADCY5O95622 1261 aa20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 KRT32Q14532 448 aa20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 MED23Q9ULK4 1368 aa20.08■□□□□ 0.81
HCLS1-202ENST00000428394 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.08■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.08■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF4Q96M43 638 aa20.08■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.07■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 HSPA1LP34931 641 aa20.07■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.07■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 GRM8O00222 908 aa20.06■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.06■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 SPG7Q9UQ90 795 aa20.06■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 KIF1AQ12756 1690 aa20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.05■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 FIBPO43427 364 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 PIP4K2BP78356 416 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 PTH1RQ03431 593 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 LGR6Q9HBX8 967 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 AACSQ86V21 672 aa20.04■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K11Q16584 847 aa20.03■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.03■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.03■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 SLC27A2O14975 620 aa20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 ME3Q16798 604 aa20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HCLS1-202ENST00000428394 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 RPS6KB1P23443 525 aa20.01■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 KCNJ4P48050 445 aa20.01■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.01■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 PXDNQ92626 1479 aa20.01■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 LARGE1O95461 756 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ADCK5Q3MIX3 580 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 NEXNQ0ZGT2 675 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ST3GAL1Q11201 340 aa20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ATL3Q6DD88 541 aa19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1524Q8TCG1 905 aa19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 TPCN1Q9ULQ1 816 aa19.99■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 SASH1O94885 1247 aa19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 COPRSQ9NQ92 184 aa19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 ATP5JP18859 108 aa19.97■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 FSD1Q9BTV5 496 aa19.97■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 KIF3AQ9Y496 699 aa19.97■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 SPEF2Q9C093 1822 aa19.97■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 KCNQ3O43525 872 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 PSME1Q06323 249 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 TTC6Q86TZ1 520 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 SUCLG2Q96I99 432 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 CLSTN2Q9H4D0 955 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM94Q12767 1356 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 MYH15Q9Y2K3 1946 aa19.96■□□□□ 0.79
HCLS1-202ENST00000428394 CTAGE5O15320 804 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 C14orf37Q86TY3 774 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 C5P01031 1676 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms