RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.23□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.23□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.23□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.22□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.22□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL15A1P39059 1388 aa12.21□□□□□ -0.45
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC24BO95487 1268 aa12.21□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.21□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.21□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUCLG2Q96I99 432 aa12.2□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.17□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BAG6P46379 1132 aa12.17□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNQ4P56696 695 aa12.17□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.17□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZPR1O75312 459 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTX1Q13505 466 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.16□□□□□ -0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BMP2KLQ5H9B9 411 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCN7AQ01118 1682 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUP98P52948 1817 aa12.16□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSFA2P28290 1259 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFC4P35249 363 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASP7P55210 303 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARP10Q53GL7 1025 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NARFQ9UHQ1 456 aa12.15□□□□□ -0.46
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SALL3Q9BXA9 1300 aa12.14□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAMTA2O94983 1202 aa12.14□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC22Q5TAA0 569 aa12.14□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAB11FIP3O75154 756 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OTUD5Q96G74 571 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.13□□□□□ -0.47
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.13□□□□□ -0.47
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