RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.61■■□□□ 1.21
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.61■■□□□ 1.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTG4Q9NY30 223 aa22.61■■□□□ 1.21
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNNI3KQ59H18 835 aa22.59■■□□□ 1.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.59■■□□□ 1.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.59■■□□□ 1.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.59■■□□□ 1.21
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCTP1Q6DN14 999 aa22.58■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.58■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM227BQ96M60 508 aa22.58■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.57■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSD1Q9BTV5 496 aa22.57■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRKQ9NRH2 765 aa22.57■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB4P16144 1822 aa22.57■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DISP2A7MBM2 1401 aa22.56■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5JP18859 108 aa22.56■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNB2Q92953 911 aa22.56■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.55■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.55■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGBQ92521 554 aa22.55■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.55■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NECTIN1Q15223 517 aa22.54■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARXQ96QS3 562 aa22.54■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.54■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0D9SFI3 127 aa22.54■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.53■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED23Q9ULK4 1368 aa22.53■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD1O95696 1058 aa22.53■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 AK2P54819 239 aa22.53■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.53■■□□□ 1.2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.53■■□□□ 1.2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.52■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUFY3Q7L099 469 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG3Q9NT62 314 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.51■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPA1P15085 419 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRP6O75581 1613 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JCADQ9P266 1359 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRE11P49959 708 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCIRG1Q13488 830 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ4P48050 445 aa22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS53Q5VIR6 699 aa22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.49■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAUS7Q99871 368 aa22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL9O00512 1426 aa22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STARD3NLO95772 234 aa22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR108Q9NPR9 543 aa22.48■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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