RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418161.1

CCDC13-AS1-201, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 2,049 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ITPRIPQ8IWB1 547 aa12.33□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LINS1Q8NG48 757 aa12.33□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.33□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MTFR1LQ9H019 292 aa12.33□□□□□ -0.43
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NPHP1O15259 732 aa12.33□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DDR1Q08345 913 aa12.33□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COG6Q9Y2V7 657 aa12.33□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TM4SF1P30408 202 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SUSD4Q5VX71 490 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RGL2O15211 777 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SERPINB2P05120 415 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GCKRQ14397 625 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PARP10Q53GL7 1025 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SYNE4Q8N205 404 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM89AQ96GI7 184 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.31□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MS4A1P11836 297 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PDE3AQ14432 1141 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ALDH1L1O75891 902 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NTSR2O95665 410 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CNBD1Q8NA66 436 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.3□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 POLD1P28340 1107 aa12.29□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.29□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MEIS3Q99687 375 aa12.29□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GRM8O00222 908 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ERFEQ4G0M1 354 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRR5LQ6MZQ0 368 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 USP44Q9H0E7 712 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PTGER2P43116 358 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NYXQ9GZU5 481 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SPON1Q9HCB6 807 aa12.28□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCC12Q96J65 1359 aa12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KLHL34Q8N239 644 aa12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CRBNQ96SW2 442 aa12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.27□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 H7C1W4 665 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ST5P78524 1137 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UTRNP46939 3433 aa12.26□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CASP7P55210 303 aa12.25□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SUCLG2Q96I99 432 aa12.25□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UTYO14607 1347 aa12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GNAI3P08754 354 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KAZALD1Q96I82 304 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.23□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GNAI2P04899 355 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NLRP3Q96P20 1036 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BRIP1Q9BX63 1249 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa12.22□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PDE8AO60658 829 aa12.21□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.21□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.21□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.21□□□□□ -0.45
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHRNA5P30532 468 aa12.21□□□□□ -0.46
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CTSWP56202 376 aa12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms