RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H3BM21 787 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BMP1P13497 986 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP6V1AP38606 617 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MSS51Q4VC12 460 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRICD5Q6PL45 260 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NME9Q86XW9 330 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SBNO1A3KN83 1393 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FLT4P35916 1363 aa6.78□□□□□ -1.32
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITSN1Q15811 1721 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHL1O00533 1208 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BECN1Q14457 450 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL27Q8NEV9 243 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.77□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPRCP08575 1304 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUCB1Q02818 461 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RDH13Q8NBN7 331 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC102AQ96A19 550 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.76□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SKOR1P84550 965 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MBIPQ9NS73 344 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MST1RQ04912 1400 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP19O94966 1318 aa6.75□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGS3P49796 1198 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GSK3AP49840 483 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NLRP7Q8WX94 980 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHOX2BQ99453 314 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.74□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MMP16P51512 607 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRB1P82279 1406 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.73□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HMOX1P09601 288 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXB7P09629 217 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GCGRP47871 477 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AK7Q96M32 723 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.72□□□□□ -1.33
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNX21Q969T3 373 aa6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DCTPP1Q9H773 170 aa6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCAPD2Q15021 1401 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALDH1A1P00352 501 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SULF1Q8IWU6 871 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPYL6Q8N831 410 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IP6K1Q92551 441 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNNQ9UQP3 1299 aa6.7□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGS12O14924 1447 aa6.69□□□□□ -1.34
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HMMRO75330 724 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms