RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.91□□□□□ -1.62
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LRRTM4-201ENST00000409088 CDC45O75419 566 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SSH3Q8TE77 659 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1FO60840 1977 aa4.91□□□□□ -1.62
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.91□□□□□ -1.62
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LRRTM4-201ENST00000409088 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.9□□□□□ -1.62
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.9□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB11FIP3O75154 756 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 MX1P20591 662 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP4K2BP78356 416 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 A1BGP04217 495 aa4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 CASC1Q6TDU7 716 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 RILPL2Q969X0 211 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMOD3Q9NYL9 352 aa4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 EPAS1Q99814 870 aa4.88□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 HSCBQ8IWL3 235 aa4.88□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.88□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 STAP2Q9UGK3 403 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WZG4 1122 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.87□□□□□ -1.63
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