RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 RHPN1Q8TCX5 695 aa36.37■■■■□ 3.41
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LMO2-202ENST00000395833 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa36.35■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 NUP98P52948 1817 aa36.34■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 NLRP10Q86W26 655 aa36.34■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 FOXO4P98177 505 aa36.33■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 ERC1Q8IUD2 1116 aa36.33■■■■□ 3.41
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LMO2-202ENST00000395833 LY75O60449 1722 aa36.32■■■■□ 3.41
LMO2-202ENST00000395833 CAMTA2O94983 1202 aa36.32■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 TTC22Q5TAA0 569 aa36.32■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 CHMP3Q9Y3E7 222 aa36.32■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
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LMO2-202ENST00000395833 PDE1AP54750 535 aa36.29■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.29■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 FAM89AQ96GI7 184 aa36.29■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 SIL1Q9H173 461 aa36.29■■■■□ 3.4
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LMO2-202ENST00000395833 KLHDC4Q8TBB5 520 aa36.28■■■■□ 3.4
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LMO2-202ENST00000395833 SALL3Q9BXA9 1300 aa36.26■■■■□ 3.4
LMO2-202ENST00000395833 RXRBP28702 533 aa36.26■■■■□ 3.4
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LMO2-202ENST00000395833 COPRSQ9NQ92 184 aa36.26■■■■□ 3.39
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LMO2-202ENST00000395833 CDHR2Q9BYE9 1310 aa36.24■■■■□ 3.39
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LMO2-202ENST00000395833 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
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LMO2-202ENST00000395833 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.21■■■■□ 3.39
LMO2-202ENST00000395833 STAP2Q9UGK3 403 aa36.2■■■■□ 3.39
LMO2-202ENST00000395833 SASH1O94885 1247 aa36.19■■■■□ 3.38
LMO2-202ENST00000395833 PARP10Q53GL7 1025 aa36.19■■■■□ 3.38
LMO2-202ENST00000395833 SYNE4Q8N205 404 aa36.19■■■■□ 3.38
LMO2-202ENST00000395833 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
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LMO2-202ENST00000395833 SMIM5Q71RC9 77 aa36.17■■■■□ 3.38
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LMO2-202ENST00000395833 FAM177BA6PVY3 158 aa36.16■■■■□ 3.38
LMO2-202ENST00000395833 CDC45O75419 566 aa36.16■■■■□ 3.38
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LMO2-202ENST00000395833 POTEAQ6S8J7 498 aa36.07■■■■□ 3.37
LMO2-202ENST00000395833 TTLL11Q8NHH1 800 aa36.07■■■■□ 3.37
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
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LMO2-202ENST00000395833 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.07■■■■□ 3.36
LMO2-202ENST00000395833 PI4K2BQ8TCG2 481 aa36.07■■■■□ 3.36
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