RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 FAM161AQ3B820 660 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 GPTP24298 496 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 FOXO4P98177 505 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 C8orf34Q49A92 452 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 RPS6KA4O75676 772 aa25.16■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 SCN7AQ01118 1682 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 RGL2O15211 777 aa25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 GNPATO15228 680 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 FAM89AQ96GI7 184 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 COPRSQ9NQ92 184 aa25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 MYH3P11055 1940 aa25.1■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 C4AP0C0L4 1744 aa25.1■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 PARP10Q53GL7 1025 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM5Q71RC9 77 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 NARFQ9UHQ1 456 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.08■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.08■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SYNE4Q8N205 404 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 BCL11AQ9H165 835 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 PLSCR1O15162 318 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SUSD4Q5VX71 490 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 PROM2Q8N271 834 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 AK7Q96M32 723 aa25.06■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 CSF1RP07333 972 aa25.05■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SASH1O94885 1247 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 PDE1AP54750 535 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TXNRD1Q16881 649 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TTC22Q5TAA0 569 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SIL1Q9H173 461 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 LAMB2P55268 1798 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 NTSR2O95665 410 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 MX1P20591 662 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 STAP2Q9UGK3 403 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 ADRA2BP18089 450 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.01■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 PDE8AO60658 829 aa25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 ZPR1O75312 459 aa25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 APBA3O96018 575 aa25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 CTSWP56202 376 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 TTLL11Q8NHH1 800 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 AOX1Q06278 1338 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 PHF14O94880 888 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 RFC4P35249 363 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 FAM177BA6PVY3 158 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms