RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 ZPR1O75312 459 aa25.46■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 GNAI3P08754 354 aa25.46■■□□□ 1.67
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TMCO3-201ENST00000375391 CASP7P55210 303 aa25.46■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 SUSD4Q5VX71 490 aa25.46■■□□□ 1.67
TMCO3-201ENST00000375391 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.45■■□□□ 1.66
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TMCO3-201ENST00000375391 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.44■■□□□ 1.66
TMCO3-201ENST00000375391 C4AP0C0L4 1744 aa25.44■■□□□ 1.66
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TMCO3-201ENST00000375391 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.43■■□□□ 1.66
TMCO3-201ENST00000375391 UTYO14607 1347 aa25.43■■□□□ 1.66
TMCO3-201ENST00000375391 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
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TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.41■■□□□ 1.66
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TMCO3-201ENST00000375391 AAMPQ13685 434 aa25.4■■□□□ 1.66
TMCO3-201ENST00000375391 SLC15A2Q16348 729 aa25.4■■□□□ 1.66
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TMCO3-201ENST00000375391 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.38■■□□□ 1.65
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TMCO3-201ENST00000375391 MSL1Q68DK7 614 aa25.37■■□□□ 1.65
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TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.37■■□□□ 1.65
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TMCO3-201ENST00000375391 PARP10Q53GL7 1025 aa25.31■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 SSH3Q8TE77 659 aa25.3■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.3■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 POLA2Q14181 598 aa25.3■■□□□ 1.64
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TMCO3-201ENST00000375391 SMC5Q8IY18 1101 aa25.28■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 SIL1Q9H173 461 aa25.28■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 DCTPP1Q9H773 170 aa25.28■■□□□ 1.64
TMCO3-201ENST00000375391 MTX1Q13505 466 aa25.28■■□□□ 1.64
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TMCO3-201ENST00000375391 HMMRO75330 724 aa25.24■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 CTSWP56202 376 aa25.24■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 SERPINB2P05120 415 aa25.24■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TMCO3-201ENST00000375391 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.23■■□□□ 1.63
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