RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 DTNBO60941 627 aa15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SLC39A6Q13433 755 aa15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.76■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 LARGE1O95461 756 aa15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 MYL6BP14649 208 aa15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ATP2B3Q16720 1220 aa15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SASH1O94885 1247 aa15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.75■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KAZALD1Q96I82 304 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TCHHQ07283 1943 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GJB2P29033 226 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 VPS53Q5VIR6 699 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FAM227BQ96M60 508 aa15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 F13A1P00488 732 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PDIA6Q15084 440 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HIP1O00291 1037 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FIBPO43427 364 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF790Q6PG37 636 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 FSD1Q9BTV5 496 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV5-2P06315 115 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.116e-6■■□□□ 12.7
TMOD1-202ENST00000375175 NECTIN1Q15223 517 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.72■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 MYD88Q99836 296 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 UTYO14607 1347 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 SLIT3O75094 1523 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2HP62256 183 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 COPS6Q7L5N1 327 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 NECAB1Q8N987 351 aa15.71■□□□□ 0.11
TMOD1-202ENST00000375175 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ME3Q16798 604 aa15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 MAP4K1Q92918 833 aa15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 KCNB2Q92953 911 aa15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.7■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 ERBB3P21860 1342 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 KIF3AQ9Y496 699 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0D9SFI3 127 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 SLC27A2O14975 620 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 KIF20AO95235 890 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 PSMA5P28066 241 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 GCKRQ14397 625 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 MTMR6Q9Y217 621 aa15.69■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 RNF20Q5VTR2 975 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 USP25Q9UHP3 1055 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.68■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.67■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 RGPD5Q99666 1765 aa15.67■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 PHKG2P15735 406 aa15.67■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TMOD1-202ENST00000375175 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms