RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373290.6

TSPAN15-201, Transcript of tetraspanin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN15, Length 1,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15-201ENST00000373290 SSFA2P28290 1259 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 SUCLG2Q96I99 432 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 H7C1W4 665 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 RFC4P35249 363 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 ZPR1O75312 459 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 SYNE4Q8N205 404 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 CCDC125Q86Z20 511 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15-201ENST00000373290 SUSD4Q5VX71 490 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 RGL2O15211 777 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 FAM89AQ96GI7 184 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 GYS1P13807 737 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 FAM177BA6PVY3 158 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 ATP8B2P98198 1209 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 SLC15A2Q16348 729 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 NTSR2O95665 410 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 FOXO4P98177 505 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 MTX1Q13505 466 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 PARP10Q53GL7 1025 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN15-201ENST00000373290 POLA2Q14181 598 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 NFIXQ14938 502 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 ILDR2Q71H61 639 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SKAP1Q86WV1 359 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 STK32BQ9NY57 414 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 LAMB2P55268 1798 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SRGAP3O43295 1099 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SSH3Q8TE77 659 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SMC5Q8IY18 1101 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SETDB2Q96T68 719 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 MYH3P11055 1940 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 CASZ1Q86V15 1759 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 MSH5O43196 834 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.28■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 DCTPP1Q9H773 170 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 TM4SF1P30408 202 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 ERFEQ4G0M1 354 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 ABCC12Q96J65 1359 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN15-201ENST00000373290 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.26■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 HMMRO75330 724 aa24.26■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 DDR1Q08345 913 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 CSF1RP07333 972 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 CTSWP56202 376 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 GCC1Q96CN9 775 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 PDE8AO60658 829 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 MSL1Q68DK7 614 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 FAM161AQ3B820 660 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 COL4A1P02462 1669 aa24.21■■□□□ 1.47
TSPAN15-201ENST00000373290 NYXQ9GZU5 481 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms