RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM13AO94988 1023 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM157BP0CG42 384 aa7.08□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 INPP5BP32019 993 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 IDH3AP50213 366 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.08□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 HCN2Q9UL51 889 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.08□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 EFSO43281 561 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ZAP70P43403 619 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 BRD7Q9NPI1 651 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 STRN4Q9NRL3 753 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ARSDP51689 593 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP4P98171 946 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATCAYQ86WG3 371 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 SVOPQ8N4V2 548 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF24Q9UPV7 400 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 KCNQ4P56696 695 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GAS6Q14393 721 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 CD33P20138 364 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 CTBSQ01459 385 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR152Q8TDT2 470 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 MARK1Q9P0L2 795 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 USP20Q9Y2K6 914 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 FZD6O60353 706 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 MX2P20592 715 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 WHAMMQ8TF30 809 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC30A3Q99726 388 aa7.01□□□□□ -1.29
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RABGGTB-202ENST00000370826 MBIPQ9NS73 344 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 POLIQ9UNA4 740 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTB-202ENST00000370826 SPEM2Q0P670 501 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB5O43674 189 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGGTB-202ENST00000370826 MAP2K3P46734 347 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf34Q49A92 452 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 GJD3Q8N144 294 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 CITED4Q96RK1 184 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-202ENST00000370826 A6NHS1 94 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 SLURP2P0DP57 97 aa6.96□□□□□ -1.3
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