RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370206.8

CNN3-201, Transcript of calponin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN3, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-201ENST00000370206 NECTIN1Q15223 517 aa26.52■■□□□ 1.84
CNN3-201ENST00000370206 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CNN3-201ENST00000370206 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
CNN3-201ENST00000370206 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.51■■□□□ 1.84
CNN3-201ENST00000370206 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
CNN3-201ENST00000370206 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 VPS53Q5VIR6 699 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 FAM227BQ96M60 508 aa26.5■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.5■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.49■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.49■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 CPA1P15085 419 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 MAP4K1Q92918 833 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 CLCN1P35523 988 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 FSD1Q9BTV5 496 aa26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ERBB4Q15303 1308 aa26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 MED23Q9ULK4 1368 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 A0A0D9SFI3 127 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 CASP7P55210 303 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 BRINP3Q76B58 766 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 RBSNQ9H1K0 784 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-201ENST00000370206 LARGE1O95461 756 aa26.45■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.45■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 A0A087WZG4 1122 aa26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ESPNB1AK53 854 aa26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 TNNI3KQ59H18 835 aa26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.44■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 JCADQ9P266 1359 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ATP5JP18859 108 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 KCNJ4P48050 445 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SLC27A2O14975 620 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 STX6O43752 255 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SYT1P21579 422 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 TFCP2Q12800 502 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.43■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SYCE3A1L190 88 aa26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 NBPF26B4DH59 902 aa26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 NBPF14Q5TI25 921 aa26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 NBPF15Q8N660 670 aa26.42■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.41■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 PSMA5P28066 241 aa26.41■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 USP48Q86UV5 1035 aa26.41■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.41■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 RNF20Q5VTR2 975 aa26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 HSPA2P54652 639 aa26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CNN3-201ENST00000370206 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.39■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 H7C1W4 665 aa26.39■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 PAPPAQ13219 1627 aa26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 F13A1P00488 732 aa26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 ST3GAL1Q11201 340 aa26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 GJB2P29033 226 aa26.37■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 FOXO4P98177 505 aa26.37■■□□□ 1.81
CNN3-201ENST00000370206 ME3Q16798 604 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms