RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
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PTPRK-201ENST00000368202 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTPRK-201ENST00000368202 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-201ENST00000368202 ERFEQ4G0M1 354 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-201ENST00000368202 SYNE4Q8N205 404 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-201ENST00000368202 CNBD1Q8NA66 436 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-201ENST00000368202 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.08■□□□□ 0
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINB2P05120 415 aa15.08■□□□□ 0
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