RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 SIN3BO75182 1162 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 SPEM2Q0P670 501 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 NEUROD1Q13562 356 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 SYT9Q86SS6 491 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 MDFIQ99750 246 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 BCS1LQ9Y276 419 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 GDF11O95390 407 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 IRS1P35568 1242 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 TNFRSF25Q93038 417 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC30A3Q99726 388 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 PIK3R2O00459 728 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRMT3O60678 531 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 DGKZQ13574 1117 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 GRIN2CQ14957 1233 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 ELOA3Q8NG57 546 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-223P-201ENST00000362830 EPB42P16452 691 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 AMPD1P23109 780 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHSY3Q70JA7 882 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 KLK14Q9P0G3 267 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 MICAL2O94851 1124 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 ALAS2P22557 587 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 INPP5BP32019 993 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 DGKGP49619 791 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 IDH3AP50213 366 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARSDP51689 593 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 COX20Q5RI15 118 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 GSX2Q9BZM3 304 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 RRAGCQ9HB90 399 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCINQ13939 588 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 C16orf46Q6P387 395 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 IFT43Q96FT9 208 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 GNB5O14775 395 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 OPLAHO14841 1288 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP2B4P23634 1241 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 BHMTQ93088 406 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 DCAF5Q96JK2 942 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLAIN2Q9P270 581 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAP3K6O95382 1288 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 EGFRP00533 1210 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADH7P40394 386 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 TREML1Q86YW5 311 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 PNMA5Q96PV4 448 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCSK7Q16549 785 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-223P-201ENST00000362830 TNFRSF10BO14763 440 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGHA1P01876 353 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 COL8A1P27658 744 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 NFKB1P19838 968 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 STIM2Q9P246 746 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 M0R082 166 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 SSFA2P28290 1259 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 ABTB2Q8N961 1025 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM11Q96F44 468 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms