RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC174Q6PII3 467 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 PRC1O43663 620 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 HOOK3Q86VS8 718 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 ANO10Q9NW15 660 aa14.98□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 ERMNQ8TAM6 284 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 GOPCQ9HD26 462 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 IL2RBP14784 551 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 TNNT1P13805 278 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 PSMD1Q99460 953 aa14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 HAND2P61296 217 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 SIRT1Q96EB6 747 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 WDR70Q9NW82 654 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 STK32BQ9NY57 414 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 STX8Q9UNK0 236 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 KRT23Q9C075 422 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 EYA3Q99504 573 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.96□□□□□ -0.01
NLRC3-202ENST00000359128 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.96□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 USP16Q9Y5T5 823 aa14.96□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MPNDQ8N594 471 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TTC16Q8NEE8 873 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 IDEP14735 1019 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 RIMBP2O15034 1052 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 STAMBPO95630 424 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.95□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CASQ1P31415 396 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TNNI2P48788 182 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 WTAPQ15007 396 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MICU3Q86XE3 530 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LRRC45Q96CN5 670 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LMAN1P49257 510 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 SYNCQ9H7C4 482 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.94□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 YEATS4O95619 227 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 STX6O43752 255 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LUZP1Q86V48 1076 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 KIF5CO60282 957 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 UBA7P41226 1012 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.93□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 EXOC1Q9NV70 894 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 ZSCAN12O43309 604 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 PHACTR2O75167 634 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC102AQ96A19 550 aa14.92□□□□□ -0.02
NLRC3-202ENST00000359128 DNA2P51530 1060 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms