RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356667.8

PGC-201, Transcript of progastricsin, humanhuman

TSL 5

Gene PGC, Length 480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGC-201ENST00000356667 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGC-201ENST00000356667 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PGC-201ENST00000356667 F6X3S4 739 aa13.09□□□□□ -0.31
PGC-201ENST00000356667 GRIN3BO60391 1043 aa13.09□□□□□ -0.31
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PGC-201ENST00000356667 STK31Q9BXU1 1019 aa13.09□□□□□ -0.31
PGC-201ENST00000356667 NYXQ9GZU5 481 aa13.09□□□□□ -0.31
PGC-201ENST00000356667 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.09□□□□□ -0.31
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PGC-201ENST00000356667 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGC-201ENST00000356667 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.07□□□□□ -0.32
PGC-201ENST00000356667 SRGNP10124 158 aa13.07□□□□□ -0.32
PGC-201ENST00000356667 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
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PGC-201ENST00000356667 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
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PGC-201ENST00000356667 TTLL6Q8N841 843 aa13.05□□□□□ -0.32
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PGC-201ENST00000356667 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
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PGC-201ENST00000356667 IGKV5-2P06315 115 aa13.04□□□□□ -0.32
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PGC-201ENST00000356667 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.02□□□□□ -0.33
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PGC-201ENST00000356667 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PGC-201ENST00000356667 C7orf43Q8WVR3 580 aa13□□□□□ -0.33
PGC-201ENST00000356667 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PGC-201ENST00000356667 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PGC-201ENST00000356667 NLRP3Q96P20 1036 aa13□□□□□ -0.33
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