RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 USP5P45974 858 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 TBX22Q9Y458 520 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CLGNO14967 610 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 STARD3NLO95772 234 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA4P34932 840 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 RPAINQ86UA6 219 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 SLF2Q8IX21 1173 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ATP10AO60312 1499 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ATP10BO94823 1461 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM22Q9NS69 142 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 VCX3BQ9H321 246 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 STK38Q15208 465 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GBP6Q6ZN66 633 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 PREX2Q70Z35 1606 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 YEATS4O95619 227 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC175P0C221 793 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 VAV2P52735 878 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP24Q8N264 748 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-201ENST00000355233 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINC1P01008 464 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF14Q5TI25 921 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 MCTP2Q6DN12 878 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC5O00471 708 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 IDI1Q13907 227 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-201ENST00000355233 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KRT83P78385 493 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HOMEZQ8IX15 550 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RGS22Q8NE09 1264 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RILPL2Q969X0 211 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA32Q96LK8 384 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 ALDH3A1P30838 453 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF592Q92610 1267 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF3O75054 1194 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP5P59047 1200 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.64□□□□□ -1.51
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