RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.74■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 H7C1W4 665 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 IGHDP01880 384 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 CEP85Q6P2H3 762 aa27.72■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.71■■■□□ 2.03
CTU2-201ENST00000312060 PARP10Q53GL7 1025 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 SUCLG2Q96I99 432 aa27.7■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.69■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 CASP7P55210 303 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 KAZALD1Q96I82 304 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 STK32BQ9NY57 414 aa27.68■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 ATP8B2P98198 1209 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 SLC15A2Q16348 729 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 SUSD4Q5VX71 490 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 FAM89AQ96GI7 184 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.67■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.66■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 FAM177BA6PVY3 158 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 MSH5O43196 834 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 SETDB2Q96T68 719 aa27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 HMMRO75330 724 aa27.64■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 GYS1P13807 737 aa27.64■■■□□ 2.02
CTU2-201ENST00000312060 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.64■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 MYH3P11055 1940 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 SRGAP3O43295 1099 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 MTX1Q13505 466 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 SYNE4Q8N205 404 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.61■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 NTSR2O95665 410 aa27.6■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 FOXO4P98177 505 aa27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 SSH3Q8TE77 659 aa27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 NFIXQ14938 502 aa27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.59■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 NYXQ9GZU5 481 aa27.58■■■□□ 2.01
CTU2-201ENST00000312060 POLA2Q14181 598 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 DCTPP1Q9H773 170 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 SMC5Q8IY18 1101 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 GCC1Q96CN9 775 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 PDE8AO60658 829 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 TM4SF1P30408 202 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 LAMB2P55268 1798 aa27.55■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.53■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 ERFEQ4G0M1 354 aa27.52■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 CSF1RP07333 972 aa27.52■■■□□ 2
CTU2-201ENST00000312060 ILDR2Q71H61 639 aa27.51■■□□□ 1.99
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CTU2-201ENST00000312060 NPHP1O15259 732 aa27.5■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 CTSWP56202 376 aa27.5■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.49■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.49■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 SERPINB2P05120 415 aa27.49■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.49■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.48■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 DDR1Q08345 913 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 CNBD1Q8NA66 436 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CTU2-201ENST00000312060 ABCC12Q96J65 1359 aa27.46■■□□□ 1.99
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