RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NARFQ9UHQ1 456 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 SRGAP3O43295 1099 aa25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SSH3Q8TE77 659 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 ZPR1O75312 459 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF14O94880 888 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM5Q71RC9 77 aa25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 POLA2Q14181 598 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP10Q53GL7 1025 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 RFC4P35249 363 aa25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SSFA2P28290 1259 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 NUCB1Q02818 461 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SKAP1Q86WV1 359 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM89AQ96GI7 184 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-201ENST00000298838 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.74■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 SUSD4Q5VX71 490 aa25.74■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.74■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXO4P98177 505 aa25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 AKT1S1Q96B36 256 aa25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 BAG6P46379 1132 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS3P49796 1198 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF827Q17R98 1081 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH3P11055 1940 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 LNPKQ9C0E8 428 aa25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 NTSR2O95665 410 aa25.7■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.7■■□□□ 1.71
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM177BA6PVY3 158 aa25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 APBB1O00213 710 aa25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 SETDB2Q96T68 719 aa25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMB2P55268 1798 aa25.69■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNE4Q8N205 404 aa25.69■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.69■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB11FIP3O75154 756 aa25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.67■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.67■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE8AO60658 829 aa25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC125Q86Z20 511 aa25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 GYS1P13807 737 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE4AP27815 886 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 CTSWP56202 376 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 NYXQ9GZU5 481 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 COPRSQ9NQ92 184 aa25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 CSF1RP07333 972 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 NFIXQ14938 502 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM161AQ3B820 660 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.4 ms