RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TSPYL6Q8N831 410 aa15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 STK31Q9BXU1 1019 aa15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ABCC12Q96J65 1359 aa15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 NFKBIEO00221 500 aa15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 CCDC93Q567U6 631 aa15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 C1QTNF8P60827 252 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 NUP98P52948 1817 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.26■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 CCER2I3L3R5 266 aa15.26■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 SLC4A2P04920 1241 aa15.25■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.25■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 PRELPP51888 382 aa15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 KSR2Q6VAB6 950 aa15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 MYD88Q99836 296 aa15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 GLTPD2A6NH11 291 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 KIF3CO14782 793 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 VAMP4O75379 141 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 BBOX1O75936 387 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 SYNE4Q8N205 404 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 FAM89AQ96GI7 184 aa15.23■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.22■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 TOMM70O94826 608 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 OLFM4Q6UX06 510 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF428Q96B54 188 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 PSMD1Q99460 953 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 RRAGCQ9HB90 399 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 SLX4Q8IY92 1834 aa15.21■□□□□ 0.03
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF521Q96K83 1311 aa15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 FLIIQ13045 1269 aa15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.2■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 ABCC4O15439 1325 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 GRAPQ13588 217 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 G2E3Q7L622 706 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 TMC4Q7Z404 712 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 SP8Q8IXZ3 490 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 E9PSI1 815 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 JDP2Q8WYK2 163 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 VPS33BQ9H267 617 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 SBF1O95248 1867 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 PDE8AO60658 829 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 IGKV5-2P06315 115 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TMOD4-201ENST00000295314 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms