RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 USP44Q9H0E7 712 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 RGL2O15211 777 aa22.39■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 PTGER2P43116 358 aa22.39■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.39■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 SPON1Q9HCB6 807 aa22.39■■□□□ 1.18
CCDC78-201ENST00000293889 GPTP24298 496 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 GCKRQ14397 625 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 NLRP10Q86W26 655 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.36■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 GRM8O00222 908 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 GNAI3P08754 354 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 AAMPQ13685 434 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 UTYO14607 1347 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CCDC78-201ENST00000293889 H7C1W4 665 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 MMP10P09238 476 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 PARP10Q53GL7 1025 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 SUSD4Q5VX71 490 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 GNAI2P04899 355 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 CASP7P55210 303 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.31■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 POLD1P28340 1107 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 TM4SF1P30408 202 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 NFIXQ14938 502 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 SETDB2Q96T68 719 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 FAM177BA6PVY3 158 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 DDR1Q08345 913 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 FAM89AQ96GI7 184 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 SUCLG2Q96I99 432 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 SYNE4Q8N205 404 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 NTSR2O95665 410 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 KAZALD1Q96I82 304 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC78-201ENST00000293889 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 CEP85Q6P2H3 762 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 NYXQ9GZU5 481 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 FOXO4P98177 505 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 ERFEQ4G0M1 354 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 SERPINB2P05120 415 aa22.2■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 ATP8B2P98198 1209 aa22.2■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.2■■□□□ 1.15
CCDC78-201ENST00000293889 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 IGHDP01880 384 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 MTX1Q13505 466 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 CNBD1Q8NA66 436 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC12Q96J65 1359 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms